Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms