Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Nsd2-201ENSMUST00000058096 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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