Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm28047Q3US59 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm28047Q3US59 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm28047Q3US59 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm28047Q3US59 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm28047Q3US59 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm28047Q3US59 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm28047Q3US59 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm28047Q3US59 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm28047Q3US59 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm28047Q3US59 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm28047Q3US59 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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