Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms