Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nom1Q3UFM5 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nom1Q3UFM5 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms