Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 AU019990-202ENSMUST00000143964 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Lrtm1-202ENSMUST00000224708 1646 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Ube2uos-201ENSMUST00000142634 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm38033-201ENSMUST00000192037 269 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 AC131100.1-201ENSMUST00000226328 470 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Fam117bQ3U3E2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 C86187-202ENSMUST00000209497 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms