Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms