Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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