Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Perm1Q149B8 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms