Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ttc39dQ0VF76 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ttc39dQ0VF76 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ttc39dQ0VF76 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ttc39dQ0VF76 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ttc39dQ0VF76 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ttc39dQ0VF76 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ttc39dQ0VF76 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ttc39dQ0VF76 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ttc39dQ0VF76 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ttc39dQ0VF76 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ttc39dQ0VF76 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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