Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Itgb8Q0VBD0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Itgb8Q0VBD0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Itgb8Q0VBD0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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