Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ttc21bQ0HA38 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ttc21bQ0HA38 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ttc21bQ0HA38 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ttc21bQ0HA38 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ttc21bQ0HA38 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ttc21bQ0HA38 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ttc21bQ0HA38 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ttc21bQ0HA38 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ttc21bQ0HA38 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms