Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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