Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms