Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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