Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms