Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg6P61406 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg6P61406 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg6P61406 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms