Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Atp5bP56480 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms