Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Tmod1P49813 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Tmod1P49813 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Tmod1P49813 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Tmod1P49813 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Tmod1P49813 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Tmod1P49813 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Tmod1P49813 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Tmod1P49813 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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