Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
TtlP38585 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtlP38585 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtlP38585 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtlP38585 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtlP38585 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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TtlP38585 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtlP38585 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms