Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms