Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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Hoxc11P31313 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Hoxc11P31313 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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