Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms