Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PtprmP28828 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PtprmP28828 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PtprmP28828 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
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PtprmP28828 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
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PtprmP28828 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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