Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RxraP28700 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RxraP28700 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RxraP28700 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RxraP28700 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
RxraP28700 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RxraP28700 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RxraP28700 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RxraP28700 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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