Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms