Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PparaP23204 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PparaP23204 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PparaP23204 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PparaP23204 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PparaP23204 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PparaP23204 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PparaP23204 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PparaP23204 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PparaP23204 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PparaP23204 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PparaP23204 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PparaP23204 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PparaP23204 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PparaP23204 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PparaP23204 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PparaP23204 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PparaP23204 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PparaP23204 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PparaP23204 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PparaP23204 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PparaP23204 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PparaP23204 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PparaP23204 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PparaP23204 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PparaP23204 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PparaP23204 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PparaP23204 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PparaP23204 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PparaP23204 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PparaP23204 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PparaP23204 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms