Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms