Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csf1P07141 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csf1P07141 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Csf1P07141 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms