Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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