Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms