Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 C130036L24Rik-202ENSMUST00000137643 3109 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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