Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Fam240a-201ENSMUST00000177678 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm9864-201ENSMUST00000090043 1656 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms