Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms