Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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