Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krt6bQ9Z331 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms