Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms