Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms