Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lgr5Q9Z1P4 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lgr5Q9Z1P4 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lgr5Q9Z1P4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lgr5Q9Z1P4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lgr5Q9Z1P4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lgr5Q9Z1P4 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lgr5Q9Z1P4 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Lgr5Q9Z1P4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Lgr5Q9Z1P4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Lgr5Q9Z1P4 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Lgr5Q9Z1P4 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Lgr5Q9Z1P4 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Lgr5Q9Z1P4 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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