Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms