Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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