Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms