Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Atp6v1h-205ENSMUST00000192847 1662 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ms4a4bQ9ES61 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Mterf4-201ENSMUST00000027492 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms