Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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TrmuQ9DAT5 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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TrmuQ9DAT5 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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TrmuQ9DAT5 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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