Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms