Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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