Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Trappc6bQ9D289 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Trappc6bQ9D289 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Trappc6bQ9D289 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Trappc6bQ9D289 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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