Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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