Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PsenenQ9CQR7 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms