Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Atp6v0e1Q9CQD8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Atp6v0e1Q9CQD8 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
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Atp6v0e1Q9CQD8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Atp6v0e1Q9CQD8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Atp6v0e1Q9CQD8 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Atp6v0e1Q9CQD8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Atp6v0e1Q9CQD8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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